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副教授

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张坤晓

时间:2019年08月01日    来源:    作者:    阅读:

张坤晓,校聘副教授,硕士生导师。2012年在武汉大学生命科学学院获理学博士学位。江苏省科技副总,双创博士。在攻读博士学位期间,参与了两项国家自然科学基金项目的研究工作,致力于以模式植物拟南芥为研究对象研究环境因子通过植物激素调控根系生长发育过程,在本领域知名期刊发表5篇研究论文,其中作为第一作者发表在Plant Journal上。博士毕业后,赴美国南加州大学从事博士后研究工作,在Vadim Cherezov教授课题组主要负责配体-蛋白相互作用筛选以及膜蛋白结晶技术的开发,并参与了两个美国国立健康研究院(NIH)科研项目。目前主要从事生物工具酶、蛋白质定向进化和海洋药物活性分子筛选的相关研究工作。

主要研究方向:

(1)生物工具酶:主要进行一些生物学中常用工具酶,比如限制性内切酶、DNA聚合酶和糖工程酶等的从实验室小量制备规模到工业生产规模的放大工艺的研发工作。

(2)酶定向进化:针对现有生物工具酶存在的一些固有缺陷,比如酶活效率低、对反应温度敏感、自身状态不稳定等状态,根据蛋白质三维立体结构和生物信息学分析,通过对相应位置的氨基酸残基进行定点突变,来筛选能改善其缺点的新型生物工具酶。

(3)海洋药物活性分子筛选:通过对药物靶向蛋白的三维结构和生物信息学分析,筛选来自海洋的相关药物活性分子,并进行相关的下游分析和验证实验。

主要研究项目:

1.2006.01-2006.12拟南芥中CDPK相关蛋白激酶参与调控ABA信号的分子机制研究,国家自然科学基金面上项目,主研(排名第四)

2.2010.01-2013.12生长素运输与拟南芥向光性生长和根发育调控研究,家自然科学基金重点项目,主研(排名第七)

3.2014.01-2016.12改造T4噬菌体包装机器实现DNA可控跨膜转运及应用,家自然科学基金面上项目,主研(排名第四)

4.2014.01-2016.12 Molecular Mechanism of Allosteric Modulation of the Oxytocin Receptor by Sterols ,主研(排名第六)

5.2010.09-2015.08 HT structure determination of GPCRs by LCP serial femtosecond nanocrystallography ,主研(排名第七)

6. 2016.09-2018.08转录因子HY5/HYH在根光形态建成中的作用机制,江苏省教育厅面上项目,主持(排名第一)

7. 2017.01-2019.01转录因子HY5/ HYH在根光形态建成中的功能研究,国家青年自然科学项目主持(排名第一)

代表性论文:

1.Blue-light-induced PIN3 polarization for root negative phototropic response in Arabidopsis.Zhang KX, Xu HH, Yuan TT, Zhang L, Lu YT. Plant J. 2013 Oct;76(2):308-21.

2.Proper PIN1 distribution is needed for root negative phototropism in Arabidopsis.Zhang KX, Xu HH, Gong W, Jin Y, Shi YY, Yuan TT, Li J, Lu YT. PLoS One. 2014 Jan 21;9(1):e85720.

3.Glucose inhibits root meristem growth via ABA INSENSITIVE 5, which represses PIN1 accumulation and auxin activity in Arabidopsis.Yuan TT, Xu HH,Zhang KX, Guo TT, Lu YT. Plant Cell Environ. 2014 Jun;37(6):1338-50.

4.Low temperature inhibits root growth by reducing auxin accumulation via ARR1/12.Zhu J,Zhang KX, Wang WS, Gong W, Liu WC, Chen HG, Xu HH, Lu YT. Plant Cell Physiol. 2015 Apr;56(4):727-36.

5.A mutation of casein kinase 2 α4 subunit affects multiple developmental processes in Arabidopsis.Wang WS, Zhu J,Zhang KX, Lü YT, Xu HH. Plant Cell Rep. 2016 May;35(5):1071-80.


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