卢辰,校聘副教授,硕士生导师。2012年12月毕业于华中农业大学蔬菜学专业,获农学博士学位。长期从事生物信息学和基因组学研究工作,曾经主持国家自然科学基金1项、江苏省自然科学基金1项等纵横向项目5项,在研项目经费30余万元。与莫纳(连云港)生物科技有限公司、江苏愚公生命科技有限公司等科技型企业建立了良好的科学研究和创新合作关系。曾经在Mol Biol Evol、Nucleic Acids Res等高水平期刊上发表8篇学术论文,申请发明专利2项。入选江苏省“科技副总”,被评为淮海工学院2017年度“三育人”先进个人。
主要研究方向:
1.基因组调控元件的鉴定及功能分析
利用高通量测序数据,采用生物信息学方法鉴定基因组内的转座子、小RNA、非编码区域等调控元件,并分析其生物学功能。
2.蛋白质定向进化
基于蛋白质三维结构模型,设计天然蛋白质的突变方案,对蛋白质进行改造,改变天然蛋白质分子性质,从而开发新的工具酶等功能蛋白。
3.基于受体结构的计算机虚拟筛选
基于蛋白质三维结构模型,通过计算机分子模拟蛋白质与配体之间的相互作用,用于开发药物先导化合物。
主要研究项目:
(1)番茄特有miRNA基因在驯化过程中的功能演化,国家自然科学基金,2016-2018年
(2)茄属特有微小RNA基因的功能进化,江苏省自然科学基金,2015-2018年
(3)重组核糖核酸酶抑制剂开发,企业合作课题,2018-2019年
(4)荧光染料测试,企业合作课题,2016-2017年
代表性成果:
(1)Transcriptome Profiles Reveal New Regulatory Factors of Anthocyanin Accumulation in a Novel Purple-colored Cherry Tomato Cultivar Jinling Moyu.Plant Growth Regulation. 2019. 87:9-18。(并列第一作者,影响因子2.081)
(2)Miniature inverted-repeat transposable elements (MITEs) have been accumulated through amplification bursts and play important roles in gene expression and species diversity in Oryza sativa.Mol Biol Evol, 2012. 29:1005-1017. (第一作者,影响因子10.217)
(3)GISSD: Group I Intron Sequence and Structure Database.Nucleic Acids Res. 2008. 36:D31-37. (并列第一作者,影响因子11.561)